巧克力囊肿手术后，部分女性可以正常怀孕，但是具体怀孕几率有多大，这个和病情程度有关，因为巧克力囊肿对卵巢排卵就有一定的影响，加上手术对卵巢的损伤，这个具体的怀孕几率因人而异。如果想怀孕，需要做好以下几点：

1、监测排卵。巧克力囊肿手术后及早怀孕是预防复发的最有效的手段之一。如果监测排卵正常，可以正常备孕；如果监测排卵异常，可能还需要促排卵治疗。

2、定期复查。虽然手术把病变部位去除了，但是巧克力囊肿术后复发的可能性还是很大的，定期做好复查也是很重要的。

3、日常预防。虽然目前巧克力囊肿的发病机制还没有完全明晰，经血逆流是目前认可度比较高的一个原因，所以要注意不要经期同房以及避免经期做妇科检查。